Jusqu'au milieu des années 1960, il n’existait pas encore, ni au Canada ni au Québec, de soutien organisé de la recherche en santé.

À cette époque, les chercheurs allaient dans les hôpitaux afin de se rapprocher de leurs thématiques d'étude et de leurs patients. Comme la structure hospitalière ne prévoyait pas de postes budgétaires pour les payer, pour équiper les laboratoires et pour fournir du matériel aux bibliothèques, on créa en 1964 le Conseil de recherches médicales du Québec (CRMQ) – qui allait devenir le Fonds de recherche du Québec - Santé (FRQS) – afin de pallier cette situation.

C'est dans ce contexte général que, depuis près de 50 ans, des initiatives gouvernementales (provinciale et fédérale), paragouvernementales et privées ont été mises de l’avant au Québec pour rattraper les autres pays en matière de recherche. La recherche publique, qui était antérieurement le fait d'individus isolés ou de groupes restreints, s'est peu à peu transformée pour devenir l'affaire de centres, puis de réseaux nationaux et internationaux acquérant, du coup, une dimension multisectorielle et interdisciplinaire.

1964

-Création du Conseil de recherches médicales et du ministère de l’Éducation du Québec

1966

-Création du Conseil des sciences du Canada

1969

-Création du Conseil de recherches médicales du Canada (CRM)
-Création de l’Institut national de la recherche scientifique (INRS)

1974

-Le Conseil de recherches médicales devient le Conseil de la recherche en santé du Québec

1977

-Création du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie (CRSNG)

1979

-Création du Conseil québécois de la recherche sociale (CQRS), qui deviendra par la suite le Fonds québécois de la recherche sur la société et la culture (FQRSC)

1981

-Le Conseil de la recherche en santé du Québec devient le Fonds de la recherche en santé du Québec (FRSQ)
-Création du Fonds pour la formation des chercheurs et l'aide à la recherche (Fonds FCAR) qui deviendra par la suite le Fonds québécois de la recherche sur la nature et les technologies (FQRNT)

1983

-Projet de loi 19, la Loi favorisant le développement scientifique et technologique du Québec

1988

-Mise sur pied des Réseaux nationaux de centres d’excellence (Canada)

1997

-Création de la Fondation canadienne pour l’innovation (FCI)

1999

-Création du ministère de la Recherche, de la Science et de la Technologie (Québec)

2000

-Démarrage des Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC)
-Création de Génome Canada et de Génome Québec

2001

-Dépôt par le ministère de la Recherche, de la Science et de la Technologie (MRST) de la Politique québécoise de la science et de l’innovation – Savoir changer le monde
-Restructuration des missions des trois Fonds subventionnaires québécois. Celle du FRSQ s'élargit à l'ensemble de la recherche publique en santé, tous secteurs confondus, qu'elle soit effectuée en milieu hospitalier ou universitaire.

2005

-Le FRSQ et les deux autres Fonds de recherche du Québec relèvent du ministère du Développement économique, de l'Innovation et de l'Exportation (MDEIE)

2006

-Lancement de la Stratégie québécoise de la recherche et de l’innovation - Un Québec innovant et prospère (SQRI) par le ministère du Développement économique, de l’Innovation et de l'Exportation (MDEIE)

2010

-Lancement de la Stratégie québécoise de la recherche et de l’innovation 2010-2013 par le ministère du Développement économique, de l’Innovation et de l’Exportation (MDEIE)

2011

-Adoption du projet de loi 130
Le FRSQ devient le Fonds de recherche du Québec - Santé (FRQS), le FQRSC devient le Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FRQSC) et le FQRNT devient le Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FRQNT).
Création du poste de Scientifique en chef du Québec.

Le FRQS : un organisme au service de la recherche en santé

Depuis près de 50 ans, le FRQS planifie, développe et anime le milieu dynamique de la recherche publique en santé au Québec. Premier organisme du genre au Canada, il est au cœur d'un important réseau d'infrastructures de recherche – un modèle efficace repris ailleurs au Canada et dans le monde lui permettant :

-d'appuyer les chercheurs et les étudiants les plus performants;

-de valoriser l’excellence scientifique, clinique et éthique;

-d'encourager le transfert des connaissances ainsi que la valorisation et la diffusion du savoir;

-de favoriser la synergie de même que le partenariat national et international.

Le FRQS soutient 18 centres, 9 groupes et 18 réseaux thématiques. Ce vaste ensemble réunit près de 3 000 chercheurs et 6 000 étudiants aux cycles supérieurs et aux études postdoctorales.

Les centres de recherche du FRQS sont situés dans les établissements de santé à vocation universitaire (centres hospitaliers universitaires, instituts universitaires et centres affiliés universitaires) et chacun d'eux regroupe une masse critique de chercheurs. Ceci permet aux établissements de santé de réaliser leurs missions de recherche et d'enseignement exigées pour une reconnaissance universitaire. La programmation de chaque centre de recherche s'harmonise avec les secteurs d’excellence de soins et de formation de son établissement de santé hôte. Le FRQS veille à la complémentarité des programmations entre établissements. Les centres de recherche constituent le lieu privilégié de transfert des connaissances en bonnes pratiques de soins et de services.

Les groupes de recherche du FRQS sont situés en milieu universitaire et regroupent un nombre plus limité de chercheurs qui travaillent ensemble sur un thème d’intérêt commun.

Les réseaux de recherche du FRQS, quant à eux, relient de manière virtuelle autour d'une thématique de santé donnée des chercheurs issus pour la plupart d’un centre ou d'un groupe du FRQS. Les membres des réseaux peuvent également provenir d'autres milieux non financés par le FRQS tels que des centres locaux de services communautaires (CLSC), des régies régionales ou des entreprises du secteur privé. En réunissant les experts québécois sur une thématique donnée, les réseaux constituent un outil privilégié pour l’établissement de liens de recherche nationaux et internationaux.

Le FRQS considère que l'accès des chercheurs à un environnement doté d'une infrastructure humaine et technologique adéquate est un facteur important dans le maintien de leur compétitivité. C'est pourquoi il investit, selon une stratégie à effet de levier, près de la moitié de ses ressources financières dans le soutien de ces trois programmes.

Le Québec affiche une excellente performance dans le domaine de la recherche en santé. Alors qu'il ne compte que 23 % de la population canadienne, il recueille en moyenne 30 % du financement provenant des Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC), le principal organisme subventionnaire de la recherche en santé du Canada.